Alfred Bodenheimer dirige le centre d'études juives à l'Université de Bâle. Il a suivi des études de Talmud à la Yeshiva University à New York et à la Yeshivat Hamivtar en Israël. De 2005 à 2008 il a dirigé la Haute Ecole d'Etudes Juives (Hochschule für Jüdische Studien) à Heidelberg. De 2010 à 2012 il a été doyen de la faculté de théologie de l'Université de Bâle.